حجتالاسلام حسن مرادی، مدیر حوزه علمیه امام خمینی(ره) ۲، در روایت خود از درگذشت حجتالاسلام والمسلمین محمدمهدی صدیقی گفت: آقا محمدمهدی مدتی از بیماری قلبی و کبدی رنج میبردند. دیشب در نماز جماعت مسجد حضور یافته بودند و حال عمومیشان نسبتاً مناسب بود، اما از اتفاقات اخیر بهشدت ناراحت بودند و میگفتند: «دارم دق میکنم، حالم خوب نیست.»
سحرگاه امروز، هنگام سجده در منزل، خانواده متوجه میشوند که مدتی حرکتی ندارند. پس از بررسی، مشخص میشود که ایشان دار فانی را وداع گفتهاند. به گفته پزشک معالج، علت فوت ایست قلبی بوده است.